すでに退職しているが、承認途中の文書が残っており、承認を進めることも退職処理もできません。

該当の承認ステップがOR承認の場合は、退職者以外の承認者にて承認を進めることで、最終承認まで完了させることができます。

固定やAND承認の場合は、飛越承認にて承認を進めるか、従業員メンテナンスより該当の文書を申請者へ差戻してください。
（差戻した文書は、承認ルートを選びなおして再申請してください。）

上記の処理をおこなったうえで、承認ルートから退職者を外すことで退職処理が可能となります。